病毒感染宿主细胞的受体分布情况决定病毒的存在及富集部位，能否检测到取决于标本的质量，包括标本采集和其后的保存运输等环节。呼吸道病毒在鼻咽部的柱状上皮细胞内含的滴度相对较高，采集该部位的样本利于病毒的检出。
一、标本采集部位：
主要是呼吸道分泌物标本，包括：鼻拭子、咽拭子、口咽腔洗液、鼻腔洗液。根据试验要求不同，部分试验也使用静脉血标本。CDC要求采集鼻咽拭子。
二、标本采集所用器材:
病毒运送液、病毒采样拭子、冰袋、冰壶、记号笔、标本采集登记表病毒运送液。（尽可能采用商品化的病毒采样拭子和病毒运送液）
三、标本采集方法：
咽拭子：用拭子擦拭双侧咽扁桃体及咽后壁，将棉签头部浸入3-4ml采集液中，尾部弃去。
鼻拭子：将无菌拭子轻轻插入鼻道内鼻腭处，停留片刻后缓慢转动退出，以同一拭子擦拭两侧鼻孔。将拭子头部浸入3-4ml采集液中，尾部弃去。
四、病毒采样拭子的使用及标本收集注意事项：
操作要细心，严防标本间交叉污染，要做好自我保护
采集标本要有一定力度
标本采集后应迅速至于冰上或者4 ℃以下保存，因为流感病毒对热很敏感
标本管上写明：医院名称，标本号，患者姓名，性别， 采样日期
标本采集后尽量在24小时内送到实验室进行检测。24小时内未能进行病毒分离的标本应放-70 ℃或以下。
五、标本的运送要求
1、新鲜的临床采集标本应保存在4℃条件下，24小时内运送至实验室；未能24小时内送至实验室的，应置-70℃或以下保存。
2、冻存的临床采集标本应在冻存的条件下，低温送至实验室。
